Cystein ist eine wasserfürchtende Aminosäure. Ihre Form in Foldit ist ununterscheidbar von Serin. Allerdings ist Serin wasserliebend und kann anhand der Farbe von Cystein unterschieden werden.

Cystein kann eine kovalente Bindung (Atombindung) mit einem anderen Cystein in einem anderen Teil des Moleküls, oder sogar zu einem Cystein in einer anderen Untereinheit des gleichen Proteins bilden. Diese Bindung wird als Disulfidbrücke bezeichnet. Diese Brücke hilft, das Protein zu stabilisieren, besonders in denen, die von Zellen getrennt sind. Die Anwesenheit eines Paares Cystein in einem Protein weist auf eine mögliche, aber nicht notwendige Disulfidbrücke hin.
Disulfidbrücken werden in Foldit ähnlich dargestellt wie Wasserstoffbrücken, sie sind aber grün-gelb statt blau-weiß. Sie werden nur angezeigt, wenn unter View "Show bonds (sidechain)" angekreuzt ist.

Mehr Informationen können gefunden werden unter http://de.wikipedia.org/wiki/Cystein

Disulfidbrücken: http://de.wikipedia.org/wiki/Disulfidbr%C3%BCckenbindung

Dreibuchstabencode	Einbuchstabencode	Hydropathy Index
Cys	C	2,5
Cartoon Thin	Stick+H	Stick+polarH
Score/Hydro+CPK	Score/Hydro+CPK	Score/Hydro+CPK